双方约定社保按最低基数的有效性取决于具体的法律规定和实际操作情况。

在一些国家或地区，法律规定了社保缴纳的最低基数，雇主和员工必须按照规定缴纳社保费用。如果双方约定的社保基数低于法律规定的最低基数，则该约定无效。

在一些地区，雇主和员工可以自行协商社保基数，但必须符合法律规定的最低标准，否则该约定无效。

因此，在制定双方约定时，应仔细研究当地的法律规定和相关政策，以确保约定的有效性和合法性。