国企停薪留职的后果可以从多个方面来分析。

首先，对于停薪留职期间员工的社会保险问题，通常单位会继续为其缴纳，但个人部分仍需员工自己承担。如果员工长时间停薪留职，此期间的社会保险问题可能会有所影响，具体情况需根据所在地的社保政策来确定。

其次，停薪留职期间员工与原单位的人事关系会发生变化。在此期间，员工不再享受与在职员工相同的工作待遇，包括工资、奖金等。此外，由于人事关系的变化，员工可能无法参与单位的职称评定、晋升等职业发展机会。

此外，对于长期停薪留职的员工，单位可能会根据内部规定进行相应的处理。例如，在达到一定的停薪留职期限后，单位可能会根据规定将员工的人事关系转移至其他部门或办理离职手续。此时，员工与原单位将不再具有劳动关系。

需要注意的是，随着劳动法的不断完善和国企改革的深入推进，国企停薪留职的规定和政策也在不断变化。因此，在考虑停薪留职前，建议员工仔细阅读相关规定和政策，并与单位相关部门进行沟通，确保自己了解所有细节和可能的后果。

综上所述，国企停薪留职可能会对员工的工资收入、社会保险、职业发展等方面产生影响。因此，在做出决定之前，员工需要充分了解相关规定和政策，权衡利弊，并谨慎考虑是否适合停薪留职。