首先可以人工清理，将鱼儿捞出后，用刮藻刀将缸壁上的绿藻刮掉即可。其次可以养一些食藻生物，比如金苔鼠、黑线飞狐等清洁鱼。或者可以用药物除藻，常用的就会戊二醛和硫酸铜。平时还要注意预防，加强过滤并适当遮阴，限制藻类生长。
除藻能力最强的鱼是小精灵鱼。
这种鱼的体形比较小，所以相对需要的数量会多一点，但效果也很好，不过由于它只吃藻类，等到水中藻类不足的时候，也很容易死掉。除了这种鱼之外，还可以选择黑线飞狐、接吻鱼、黑玛丽等作为工具鱼，它们也有食藻的习性，但效果比较有限
想要清除缸壁上的藻类，可以养一些吃藻的鱼，比如鼠鱼、吻鲈、清道夫、青苔鼠、黑玛丽、小精灵、花白鲢、黑线飞狐、小猴飞狐以及虹彩鹦嘴鱼等。