1.能量来源不同 。氢能源汽车是氢气和氧气发生化学反应产生电能；纯电动汽车直接把电能转化为机械能。
2.补能效率不同 。氢能源汽车平均一次加氢时长基本上在6分钟左右；纯电动汽车慢充至少需要5个小时及以上的充电时长，快充也需要一个小时左右的时间。
3.排放物不同 。氢能源汽车跟空气中的氧反应，仅产生水蒸气排出；纯电动汽车本身不排放污染大气的有害气体，但废电池处理不当会造成二次污染。
氢能源汽车的充电不同于传统的电动汽车，它是通过加注氢气来进行充能的。因此，氢能源汽车需要前往氢气加气站进行加注。目前，全球范围内已经建立了一些氢气加气站，主要集中在欧美和亚洲一些发达国家或地区，如日本、韩国、加拿大、美国、德国等。随着氢能源汽车的不断普及，未来还会有更多的氢气加气站建设。
目前，日本、韩国和中国是世界上氢能源汽车技术比较发达的国家。其中，日本拥有最早的商用氢燃料电池汽车，并在氢气基础设施建设方面处于领先地位；韩国则取得了在燃料电池关键技术上的一些重要突破，并推出了多款商用化的氢燃料电池汽车；中国也在近年来积极推动氢能源汽车的发展，在政策支持、技术研究和市场推广等方面都取得了不少进展。